1、申请书及附件齐全与规范
2、整体描述是否一致
3、内容是否专业
4、数据是否前后统一
5、各部分的说明是否合理
6、各部分的逻辑关系是否对应

1、企业获得的专利为实用新型专利或外观专利，并无实质性产品制造工艺发明专利，高新技术含金量不高，无法长时间在行业内形成核心竞争力。
2、企业获得专利权的方式是受让、受赠、并购等，对于专利技术不经过消化吸收直接应用生产，基本没有自主研发过程。

1、科技人员工作时间难确认。企业通过外聘研发人员时，工作时间难以判断，是否符合在岗183天的时间要求。
2、核心研发人员身份难确认。多数研发人员同时兼任企业高层管理人员，判断此类人员是否参与研发活动，是否具备科研技能或科研时间。
3、研发人员比例不准确。由于人员总数难以确认，研发人员的比例也同样难以判断。
4、企业生产人员的范围不准确。企业申报是否能将未参加社会保险人员算作员工总数。

1、发票开具不明确。收入与产品对应关系不明确，高新技术产品销售发票只写统称或标注代码。
2、研发项目通常采用专业术语或专用名词，销售合同多采用通用名称，项目情况与收入对应关系不明确。
3、收入范围难确定，对于产品和服务共同形成转化收入的情况，对应每项高新产品的范围难以确定。
4、收入数据难确定，由于会计日常记账原则和税务局认可的工作原则不一致，收入与日常申报资料数据不一致。

1、对于未单独核算或专账管理的情况，研发费用归集不明确。

2、研发费用数据归集和比例分配不明确，实际支出的设备，人员，材料通常要同时用于多个研发项目，所以研发费用归集和比例确定难度大。